Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
ApobE9Q414 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ApobE9Q414 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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