Protein–RNA interactions for Protein: E9Q257

Gm8237, Predicted gene 8237, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8237E9Q257 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8237E9Q257 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8237E9Q257 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8237E9Q257 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8237E9Q257 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8237E9Q257 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8237E9Q257 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8237E9Q257 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8237E9Q257 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8237E9Q257 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8237E9Q257 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8237E9Q257 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8237E9Q257 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8237E9Q257 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8237E9Q257 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm8237E9Q257 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm8237E9Q257 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms