Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC4.65□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 1700081H04Rik-201ENSMUST00000190550 1128 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
NebE9Q1W3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
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