Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

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Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pdzd2E9Q1M1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pdzd2E9Q1M1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pdzd2E9Q1M1 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pdzd2E9Q1M1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Pdzd2E9Q1M1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pdzd2E9Q1M1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pdzd2E9Q1M1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pdzd2E9Q1M1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pdzd2E9Q1M1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pdzd2E9Q1M1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pdzd2E9Q1M1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pdzd2E9Q1M1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Pdzd2E9Q1M1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdzd2E9Q1M1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdzd2E9Q1M1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdzd2E9Q1M1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdzd2E9Q1M1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdzd2E9Q1M1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdzd2E9Q1M1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdzd2E9Q1M1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdzd2E9Q1M1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdzd2E9Q1M1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdzd2E9Q1M1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdzd2E9Q1M1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdzd2E9Q1M1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdzd2E9Q1M1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdzd2E9Q1M1 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdzd2E9Q1M1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdzd2E9Q1M1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdzd2E9Q1M1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdzd2E9Q1M1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdzd2E9Q1M1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Pdzd2E9Q1M1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdzd2E9Q1M1 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdzd2E9Q1M1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdzd2E9Q1M1 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdzd2E9Q1M1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdzd2E9Q1M1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdzd2E9Q1M1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdzd2E9Q1M1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdzd2E9Q1M1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdzd2E9Q1M1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdzd2E9Q1M1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdzd2E9Q1M1 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdzd2E9Q1M1 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdzd2E9Q1M1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdzd2E9Q1M1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdzd2E9Q1M1 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdzd2E9Q1M1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pdzd2E9Q1M1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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