Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gcom1E9PZ54 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms