Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Rsph10bE9PYQ0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rsph10bE9PYQ0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Rsph10bE9PYQ0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Rsph10bE9PYQ0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rsph10bE9PYQ0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rsph10bE9PYQ0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rsph10bE9PYQ0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rsph10bE9PYQ0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rsph10bE9PYQ0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rsph10bE9PYQ0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rsph10bE9PYQ0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rsph10bE9PYQ0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rsph10bE9PYQ0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rsph10bE9PYQ0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rsph10bE9PYQ0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rsph10bE9PYQ0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rsph10bE9PYQ0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rsph10bE9PYQ0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Rsph10bE9PYQ0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms