Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FgaE9PV24 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FgaE9PV24 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FgaE9PV24 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FgaE9PV24 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FgaE9PV24 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FgaE9PV24 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FgaE9PV24 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FgaE9PV24 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FgaE9PV24 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FgaE9PV24 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FgaE9PV24 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FgaE9PV24 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FgaE9PV24 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FgaE9PV24 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FgaE9PV24 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FgaE9PV24 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FgaE9PV24 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FgaE9PV24 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FgaE9PV24 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FgaE9PV24 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FgaE9PV24 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FgaE9PV24 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FgaE9PV24 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FgaE9PV24 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FgaE9PV24 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FgaE9PV24 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FgaE9PV24 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms