Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cngb1E1AZ71 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cngb1E1AZ71 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cngb1E1AZ71 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cngb1E1AZ71 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Cngb1E1AZ71 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cngb1E1AZ71 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cngb1E1AZ71 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cngb1E1AZ71 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cngb1E1AZ71 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cngb1E1AZ71 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cngb1E1AZ71 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cngb1E1AZ71 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cngb1E1AZ71 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cngb1E1AZ71 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cngb1E1AZ71 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Cngb1E1AZ71 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cngb1E1AZ71 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cngb1E1AZ71 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cngb1E1AZ71 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cngb1E1AZ71 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Cngb1E1AZ71 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cngb1E1AZ71 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cngb1E1AZ71 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cngb1E1AZ71 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cngb1E1AZ71 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cngb1E1AZ71 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Cngb1E1AZ71 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cngb1E1AZ71 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cngb1E1AZ71 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cngb1E1AZ71 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cngb1E1AZ71 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cngb1E1AZ71 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Cngb1E1AZ71 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cngb1E1AZ71 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms