Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klhl3E0CZ16 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms