Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms