Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Atp6ap1lD3Z5W0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp6ap1lD3Z5W0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms