Protein–RNA interactions for Protein: D3Z291

Calhm1, Calcium homeostasis modulator protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calhm1D3Z291 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calhm1D3Z291 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Calhm1D3Z291 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calhm1D3Z291 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calhm1D3Z291 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calhm1D3Z291 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calhm1D3Z291 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calhm1D3Z291 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calhm1D3Z291 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calhm1D3Z291 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Calhm1D3Z291 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calhm1D3Z291 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calhm1D3Z291 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Calhm1D3Z291 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calhm1D3Z291 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calhm1D3Z291 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calhm1D3Z291 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calhm1D3Z291 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calhm1D3Z291 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calhm1D3Z291 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calhm1D3Z291 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calhm1D3Z291 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calhm1D3Z291 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calhm1D3Z291 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calhm1D3Z291 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calhm1D3Z291 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calhm1D3Z291 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calhm1D3Z291 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calhm1D3Z291 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calhm1D3Z291 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calhm1D3Z291 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calhm1D3Z291 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calhm1D3Z291 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calhm1D3Z291 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calhm1D3Z291 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calhm1D3Z291 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calhm1D3Z291 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calhm1D3Z291 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calhm1D3Z291 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Calhm1D3Z291 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calhm1D3Z291 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calhm1D3Z291 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calhm1D3Z291 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calhm1D3Z291 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calhm1D3Z291 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calhm1D3Z291 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calhm1D3Z291 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calhm1D3Z291 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calhm1D3Z291 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Calhm1D3Z291 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms