Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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BC048679D3YXE9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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BC048679D3YXE9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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BC048679D3YXE9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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BC048679D3YXE9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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BC048679D3YXE9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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BC048679D3YXE9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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BC048679D3YXE9 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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BC048679D3YXE9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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BC048679D3YXE9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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BC048679D3YXE9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
BC048679D3YXE9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
BC048679D3YXE9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
BC048679D3YXE9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
BC048679D3YXE9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
BC048679D3YXE9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
BC048679D3YXE9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
BC048679D3YXE9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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BC048679D3YXE9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
BC048679D3YXE9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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BC048679D3YXE9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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