Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc13D3YV10 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc13D3YV10 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms