Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Ube2d4D3YUH6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Ube2d4D3YUH6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms