Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm17333C6EQI3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms