Protein–RNA interactions for Protein: C0LLJ0

Kpna7, Importin subunit alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna7C0LLJ0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kpna7C0LLJ0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kpna7C0LLJ0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms