Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Phf11bB4XVQ1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Phf11bB4XVQ1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms