Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrt4B2RU40 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrt4B2RU40 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrt4B2RU40 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrt4B2RU40 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrt4B2RU40 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrt4B2RU40 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrt4B2RU40 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrt4B2RU40 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrt4B2RU40 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrt4B2RU40 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrt4B2RU40 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrt4B2RU40 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrt4B2RU40 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrt4B2RU40 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Prrt4B2RU40 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrt4B2RU40 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrt4B2RU40 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrt4B2RU40 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrt4B2RU40 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrt4B2RU40 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrt4B2RU40 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrt4B2RU40 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrt4B2RU40 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrt4B2RU40 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrt4B2RU40 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrt4B2RU40 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrt4B2RU40 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrt4B2RU40 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrt4B2RU40 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrt4B2RU40 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrt4B2RU40 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrt4B2RU40 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrt4B2RU40 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Prrt4B2RU40 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prrt4B2RU40 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms