Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssxb8B1AY40 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms