Protein–RNA interactions for Protein: B1AVN5

Zfp990, Zinc finger protein 990, mousemouse

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp990B1AVN5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Zfp990B1AVN5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms