Protein–RNA interactions for Protein: B1AQJ2

Usp36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp36B1AQJ2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp36B1AQJ2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms