Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Syndig1A2ANU3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syndig1A2ANU3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms