Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc183A2AJB1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc183A2AJB1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc183A2AJB1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc183A2AJB1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc183A2AJB1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc183A2AJB1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc183A2AJB1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc183A2AJB1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc183A2AJB1 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc183A2AJB1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc183A2AJB1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc183A2AJB1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc183A2AJB1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc183A2AJB1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc183A2AJB1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc183A2AJB1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc183A2AJB1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc183A2AJB1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms