Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Prdm16A2A935 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Prdm16A2A935 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prdm16A2A935 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prdm16A2A935 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prdm16A2A935 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prdm16A2A935 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prdm16A2A935 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prdm16A2A935 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prdm16A2A935 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prdm16A2A935 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Prdm16A2A935 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prdm16A2A935 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Prdm16A2A935 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Prdm16A2A935 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Prdm16A2A935 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
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