Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YWX0

Ighv1-19, Immunoglobulin heavy variable V1-19 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Ighv1-19A0A0A6YWX0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ighv1-19A0A0A6YWX0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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