Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Speer3W4VSP1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Speer3W4VSP1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Speer3W4VSP1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Speer3W4VSP1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Speer3W4VSP1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Speer3W4VSP1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Speer3W4VSP1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Speer3W4VSP1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Speer3W4VSP1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Speer3W4VSP1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Speer3W4VSP1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Speer3W4VSP1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Speer3W4VSP1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Speer3W4VSP1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Speer3W4VSP1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Speer3W4VSP1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Speer3W4VSP1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Speer3W4VSP1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Speer3W4VSP1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Speer3W4VSP1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Speer3W4VSP1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Speer3W4VSP1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Speer3W4VSP1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Speer3W4VSP1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Speer3W4VSP1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Speer3W4VSP1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Speer3W4VSP1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Speer3W4VSP1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Speer3W4VSP1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Speer3W4VSP1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Speer3W4VSP1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Speer3W4VSP1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Speer3W4VSP1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Speer3W4VSP1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Speer3W4VSP1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Speer3W4VSP1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Speer3W4VSP1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Speer3W4VSP1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Speer3W4VSP1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Speer3W4VSP1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Speer3W4VSP1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Speer3W4VSP1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Speer3W4VSP1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Speer3W4VSP1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Speer3W4VSP1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Speer3W4VSP1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Speer3W4VSP1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Speer3W4VSP1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Speer3W4VSP1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Speer3W4VSP1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Speer3W4VSP1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Speer3W4VSP1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Speer3W4VSP1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Speer3W4VSP1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Speer3W4VSP1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Speer3W4VSP1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Speer3W4VSP1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Speer3W4VSP1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Speer3W4VSP1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Speer3W4VSP1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Speer3W4VSP1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Speer3W4VSP1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Speer3W4VSP1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Speer3W4VSP1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Speer3W4VSP1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Speer3W4VSP1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Speer3W4VSP1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Speer3W4VSP1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Speer3W4VSP1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Speer3W4VSP1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Speer3W4VSP1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Speer3W4VSP1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Speer3W4VSP1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Speer3W4VSP1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Speer3W4VSP1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Speer3W4VSP1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Speer3W4VSP1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Speer3W4VSP1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Speer3W4VSP1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Speer3W4VSP1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Speer3W4VSP1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Speer3W4VSP1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Speer3W4VSP1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Speer3W4VSP1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Speer3W4VSP1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Speer3W4VSP1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Speer3W4VSP1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Speer3W4VSP1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Speer3W4VSP1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Speer3W4VSP1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Speer3W4VSP1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Speer3W4VSP1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Speer3W4VSP1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Speer3W4VSP1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Speer3W4VSP1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Speer3W4VSP1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Speer3W4VSP1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Speer3W4VSP1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Speer3W4VSP1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms