Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z255

Ube2a, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 A, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2aQ9Z255 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2aQ9Z255 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2aQ9Z255 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2aQ9Z255 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2aQ9Z255 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2aQ9Z255 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2aQ9Z255 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2aQ9Z255 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2aQ9Z255 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2aQ9Z255 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2aQ9Z255 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ube2aQ9Z255 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2aQ9Z255 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ube2aQ9Z255 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2aQ9Z255 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2aQ9Z255 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2aQ9Z255 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2aQ9Z255 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2aQ9Z255 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2aQ9Z255 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ube2aQ9Z255 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2aQ9Z255 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2aQ9Z255 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2aQ9Z255 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2aQ9Z255 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2aQ9Z255 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2aQ9Z255 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2aQ9Z255 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ube2aQ9Z255 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2aQ9Z255 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2aQ9Z255 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2aQ9Z255 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ube2aQ9Z255 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2aQ9Z255 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2aQ9Z255 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ube2aQ9Z255 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2aQ9Z255 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ube2aQ9Z255 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2aQ9Z255 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2aQ9Z255 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2aQ9Z255 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2aQ9Z255 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2aQ9Z255 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2aQ9Z255 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2aQ9Z255 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2aQ9Z255 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ube2aQ9Z255 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2aQ9Z255 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2aQ9Z255 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2aQ9Z255 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2aQ9Z255 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2aQ9Z255 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2aQ9Z255 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ube2aQ9Z255 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2aQ9Z255 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ube2aQ9Z255 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2aQ9Z255 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2aQ9Z255 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ube2aQ9Z255 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2aQ9Z255 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ube2aQ9Z255 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2aQ9Z255 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ube2aQ9Z255 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2aQ9Z255 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2aQ9Z255 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ube2aQ9Z255 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2aQ9Z255 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2aQ9Z255 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ube2aQ9Z255 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2aQ9Z255 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ube2aQ9Z255 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2aQ9Z255 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ube2aQ9Z255 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2aQ9Z255 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2aQ9Z255 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2aQ9Z255 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ube2aQ9Z255 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2aQ9Z255 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2aQ9Z255 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2aQ9Z255 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ube2aQ9Z255 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2aQ9Z255 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2aQ9Z255 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ube2aQ9Z255 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ube2aQ9Z255 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ube2aQ9Z255 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ube2aQ9Z255 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ube2aQ9Z255 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2aQ9Z255 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2aQ9Z255 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ube2aQ9Z255 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2aQ9Z255 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2aQ9Z255 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2aQ9Z255 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ube2aQ9Z255 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2aQ9Z255 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2aQ9Z255 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2aQ9Z255 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ube2aQ9Z255 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ube2aQ9Z255 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms