Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0U0

Xpr1, Xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xpr1Q9Z0U0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Xpr1Q9Z0U0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Xpr1Q9Z0U0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Xpr1Q9Z0U0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Xpr1Q9Z0U0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Xpr1Q9Z0U0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Xpr1Q9Z0U0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Xpr1Q9Z0U0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Xpr1Q9Z0U0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Xpr1Q9Z0U0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Xpr1Q9Z0U0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Xpr1Q9Z0U0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Xpr1Q9Z0U0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Xpr1Q9Z0U0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Xpr1Q9Z0U0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Xpr1Q9Z0U0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Xpr1Q9Z0U0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Xpr1Q9Z0U0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Xpr1Q9Z0U0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Xpr1Q9Z0U0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Xpr1Q9Z0U0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Xpr1Q9Z0U0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Xpr1Q9Z0U0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Xpr1Q9Z0U0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Xpr1Q9Z0U0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Xpr1Q9Z0U0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Xpr1Q9Z0U0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Xpr1Q9Z0U0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Xpr1Q9Z0U0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Xpr1Q9Z0U0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Xpr1Q9Z0U0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Xpr1Q9Z0U0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Xpr1Q9Z0U0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Xpr1Q9Z0U0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Xpr1Q9Z0U0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Xpr1Q9Z0U0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Xpr1Q9Z0U0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Xpr1Q9Z0U0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Xpr1Q9Z0U0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Xpr1Q9Z0U0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Xpr1Q9Z0U0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Xpr1Q9Z0U0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Xpr1Q9Z0U0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Xpr1Q9Z0U0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Xpr1Q9Z0U0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Xpr1Q9Z0U0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Xpr1Q9Z0U0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Xpr1Q9Z0U0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Xpr1Q9Z0U0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Xpr1Q9Z0U0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Xpr1Q9Z0U0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Xpr1Q9Z0U0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Xpr1Q9Z0U0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Xpr1Q9Z0U0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Xpr1Q9Z0U0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Xpr1Q9Z0U0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Xpr1Q9Z0U0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Xpr1Q9Z0U0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Xpr1Q9Z0U0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Xpr1Q9Z0U0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Xpr1Q9Z0U0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Xpr1Q9Z0U0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Xpr1Q9Z0U0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Xpr1Q9Z0U0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Xpr1Q9Z0U0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Xpr1Q9Z0U0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Xpr1Q9Z0U0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Xpr1Q9Z0U0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Xpr1Q9Z0U0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Xpr1Q9Z0U0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Xpr1Q9Z0U0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Xpr1Q9Z0U0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Xpr1Q9Z0U0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Xpr1Q9Z0U0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Xpr1Q9Z0U0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Xpr1Q9Z0U0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Xpr1Q9Z0U0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Xpr1Q9Z0U0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Xpr1Q9Z0U0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Xpr1Q9Z0U0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Xpr1Q9Z0U0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Xpr1Q9Z0U0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Xpr1Q9Z0U0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Xpr1Q9Z0U0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Xpr1Q9Z0U0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Xpr1Q9Z0U0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Xpr1Q9Z0U0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Xpr1Q9Z0U0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Xpr1Q9Z0U0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Xpr1Q9Z0U0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Xpr1Q9Z0U0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Xpr1Q9Z0U0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Xpr1Q9Z0U0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Xpr1Q9Z0U0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Xpr1Q9Z0U0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Xpr1Q9Z0U0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Xpr1Q9Z0U0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Xpr1Q9Z0U0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Xpr1Q9Z0U0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Xpr1Q9Z0U0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms