Protein–RNA interactions for Protein: Q9R216

Fzd9, Frizzled-9, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fzd9Q9R216 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28,68■■■□□ 2,18
Fzd9Q9R216 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28,68■■■□□ 2,18
Fzd9Q9R216 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28,68■■■□□ 2,18
Fzd9Q9R216 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
Fzd9Q9R216 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Fzd9Q9R216 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Fzd9Q9R216 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Fzd9Q9R216 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28,66■■■□□ 2,18
Fzd9Q9R216 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Fzd9Q9R216 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,66■■■□□ 2,18
Fzd9Q9R216 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Fzd9Q9R216 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Fzd9Q9R216 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
Fzd9Q9R216 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Fzd9Q9R216 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,63■■■□□ 2,17
Fzd9Q9R216 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Fzd9Q9R216 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28,62■■■□□ 2,17
Fzd9Q9R216 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Fzd9Q9R216 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Fzd9Q9R216 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Fzd9Q9R216 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Fzd9Q9R216 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28,6■■■□□ 2,17
Fzd9Q9R216 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
Fzd9Q9R216 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,6■■■□□ 2,17
Fzd9Q9R216 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Fzd9Q9R216 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Fzd9Q9R216 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28,57■■■□□ 2,16
Fzd9Q9R216 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Fzd9Q9R216 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Fzd9Q9R216 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28,55■■■□□ 2,16
Fzd9Q9R216 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Fzd9Q9R216 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Fzd9Q9R216 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28,55■■■□□ 2,16
Fzd9Q9R216 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Fzd9Q9R216 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28,55■■■□□ 2,16
Fzd9Q9R216 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28,54■■■□□ 2,16
Fzd9Q9R216 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Fzd9Q9R216 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Fzd9Q9R216 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Fzd9Q9R216 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Fzd9Q9R216 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28,53■■■□□ 2,16
Fzd9Q9R216 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28,52■■■□□ 2,16
Fzd9Q9R216 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28,51■■■□□ 2,15
Fzd9Q9R216 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
Fzd9Q9R216 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
Fzd9Q9R216 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Fzd9Q9R216 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,48■■■□□ 2,15
Fzd9Q9R216 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,48■■■□□ 2,15
Fzd9Q9R216 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,47■■■□□ 2,15
Fzd9Q9R216 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28,47■■■□□ 2,15
Fzd9Q9R216 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28,47■■■□□ 2,15
Fzd9Q9R216 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28,47■■■□□ 2,15
Fzd9Q9R216 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Fzd9Q9R216 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Fzd9Q9R216 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Fzd9Q9R216 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28,45■■■□□ 2,14
Fzd9Q9R216 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Fzd9Q9R216 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28,43■■■□□ 2,14
Fzd9Q9R216 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Fzd9Q9R216 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28,42■■■□□ 2,14
Fzd9Q9R216 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Fzd9Q9R216 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Fzd9Q9R216 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Fzd9Q9R216 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,13
Fzd9Q9R216 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Fzd9Q9R216 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Fzd9Q9R216 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28,38■■■□□ 2,13
Fzd9Q9R216 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28,38■■■□□ 2,13
Fzd9Q9R216 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28,36■■■□□ 2,13
Fzd9Q9R216 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,35■■■□□ 2,13
Fzd9Q9R216 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28,35■■■□□ 2,13
Fzd9Q9R216 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Fzd9Q9R216 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28,34■■■□□ 2,13
Fzd9Q9R216 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,34■■■□□ 2,13
Fzd9Q9R216 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28,32■■■□□ 2,12
Fzd9Q9R216 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,32■■■□□ 2,12
Fzd9Q9R216 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Fzd9Q9R216 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Fzd9Q9R216 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28,32■■■□□ 2,12
Fzd9Q9R216 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Fzd9Q9R216 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28,31■■■□□ 2,12
Fzd9Q9R216 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Fzd9Q9R216 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Fzd9Q9R216 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
Fzd9Q9R216 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Fzd9Q9R216 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28,27■■■□□ 2,12
Fzd9Q9R216 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28,27■■■□□ 2,12
Fzd9Q9R216 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Fzd9Q9R216 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Fzd9Q9R216 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Fzd9Q9R216 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Fzd9Q9R216 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28,25■■■□□ 2,11
Fzd9Q9R216 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28,24■■■□□ 2,11
Fzd9Q9R216 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28,24■■■□□ 2,11
Fzd9Q9R216 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Fzd9Q9R216 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Fzd9Q9R216 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Fzd9Q9R216 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Fzd9Q9R216 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28,23■■■□□ 2,11
Fzd9Q9R216 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,7 ms