Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R0

Lhx6, LIM/homeobox protein Lhx6, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx6Q9R1R0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,27■■□□□ 1,16
Lhx6Q9R1R0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22,27■■□□□ 1,16
Lhx6Q9R1R0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,27■■□□□ 1,16
Lhx6Q9R1R0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22,26■■□□□ 1,15
Lhx6Q9R1R0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22,26■■□□□ 1,15
Lhx6Q9R1R0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22,26■■□□□ 1,15
Lhx6Q9R1R0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22,25■■□□□ 1,15
Lhx6Q9R1R0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22,25■■□□□ 1,15
Lhx6Q9R1R0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,24■■□□□ 1,15
Lhx6Q9R1R0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22,24■■□□□ 1,15
Lhx6Q9R1R0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,24■■□□□ 1,15
Lhx6Q9R1R0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22,23■■□□□ 1,15
Lhx6Q9R1R0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,23■■□□□ 1,15
Lhx6Q9R1R0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,22■■□□□ 1,15
Lhx6Q9R1R0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22,22■■□□□ 1,15
Lhx6Q9R1R0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22,22■■□□□ 1,15
Lhx6Q9R1R0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,22■■□□□ 1,15
Lhx6Q9R1R0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,21■■□□□ 1,15
Lhx6Q9R1R0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22,21■■□□□ 1,15
Lhx6Q9R1R0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,2■■□□□ 1,14
Lhx6Q9R1R0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22,2■■□□□ 1,14
Lhx6Q9R1R0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22,2■■□□□ 1,14
Lhx6Q9R1R0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22,2■■□□□ 1,14
Lhx6Q9R1R0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22,19■■□□□ 1,14
Lhx6Q9R1R0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22,19■■□□□ 1,14
Lhx6Q9R1R0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,18■■□□□ 1,14
Lhx6Q9R1R0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,18■■□□□ 1,14
Lhx6Q9R1R0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22,17■■□□□ 1,14
Lhx6Q9R1R0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
Lhx6Q9R1R0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
Lhx6Q9R1R0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
Lhx6Q9R1R0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,17■■□□□ 1,14
Lhx6Q9R1R0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22,16■■□□□ 1,14
Lhx6Q9R1R0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22,16■■□□□ 1,14
Lhx6Q9R1R0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22,16■■□□□ 1,14
Lhx6Q9R1R0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
Lhx6Q9R1R0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
Lhx6Q9R1R0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22,14■■□□□ 1,13
Lhx6Q9R1R0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22,14■■□□□ 1,13
Lhx6Q9R1R0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,14■■□□□ 1,13
Lhx6Q9R1R0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,14■■□□□ 1,13
Lhx6Q9R1R0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22,13■■□□□ 1,13
Lhx6Q9R1R0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22,13■■□□□ 1,13
Lhx6Q9R1R0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
Lhx6Q9R1R0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,12■■□□□ 1,13
Lhx6Q9R1R0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,12■■□□□ 1,13
Lhx6Q9R1R0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,12■■□□□ 1,13
Lhx6Q9R1R0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
Lhx6Q9R1R0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
Lhx6Q9R1R0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
Lhx6Q9R1R0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,09■■□□□ 1,13
Lhx6Q9R1R0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22,09■■□□□ 1,13
Lhx6Q9R1R0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22,09■■□□□ 1,13
Lhx6Q9R1R0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,09■■□□□ 1,13
Lhx6Q9R1R0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,09■■□□□ 1,13
Lhx6Q9R1R0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,08■■□□□ 1,13
Lhx6Q9R1R0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22,08■■□□□ 1,13
Lhx6Q9R1R0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22,08■■□□□ 1,13
Lhx6Q9R1R0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22,08■■□□□ 1,13
Lhx6Q9R1R0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22,08■■□□□ 1,12
Lhx6Q9R1R0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,08■■□□□ 1,12
Lhx6Q9R1R0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22,07■■□□□ 1,12
Lhx6Q9R1R0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22,07■■□□□ 1,12
Lhx6Q9R1R0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,06■■□□□ 1,12
Lhx6Q9R1R0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22,06■■□□□ 1,12
Lhx6Q9R1R0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22,06■■□□□ 1,12
Lhx6Q9R1R0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,05■■□□□ 1,12
Lhx6Q9R1R0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,05■■□□□ 1,12
Lhx6Q9R1R0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,04■■□□□ 1,12
Lhx6Q9R1R0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22,03■■□□□ 1,12
Lhx6Q9R1R0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
Lhx6Q9R1R0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,12
Lhx6Q9R1R0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22,02■■□□□ 1,12
Lhx6Q9R1R0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,12
Lhx6Q9R1R0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22,02■■□□□ 1,12
Lhx6Q9R1R0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22,02■■□□□ 1,12
Lhx6Q9R1R0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22,01■■□□□ 1,11
Lhx6Q9R1R0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
Lhx6Q9R1R0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
Lhx6Q9R1R0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,01■■□□□ 1,11
Lhx6Q9R1R0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1,11
Lhx6Q9R1R0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1,11
Lhx6Q9R1R0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1,11
Lhx6Q9R1R0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21,99■■□□□ 1,11
Lhx6Q9R1R0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
Lhx6Q9R1R0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21,98■■□□□ 1,11
Lhx6Q9R1R0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21,98■■□□□ 1,11
Lhx6Q9R1R0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21,98■■□□□ 1,11
Lhx6Q9R1R0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21,98■■□□□ 1,11
Lhx6Q9R1R0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
Lhx6Q9R1R0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21,97■■□□□ 1,11
Lhx6Q9R1R0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
Lhx6Q9R1R0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
Lhx6Q9R1R0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21,97■■□□□ 1,11
Lhx6Q9R1R0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
Lhx6Q9R1R0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21,96■■□□□ 1,11
Lhx6Q9R1R0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21,96■■□□□ 1,11
Lhx6Q9R1R0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21,96■■□□□ 1,11
Lhx6Q9R1R0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
Lhx6Q9R1R0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,96■■□□□ 1,11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27,9 ms