Protein–RNA interactions for Protein: Q9R118

Htra1, Serine protease HTRA1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra1Q9R118 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Htra1Q9R118 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Htra1Q9R118 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Htra1Q9R118 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Htra1Q9R118 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Htra1Q9R118 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Htra1Q9R118 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Htra1Q9R118 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Htra1Q9R118 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Htra1Q9R118 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Htra1Q9R118 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Htra1Q9R118 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Htra1Q9R118 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Htra1Q9R118 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Htra1Q9R118 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Htra1Q9R118 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Htra1Q9R118 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Htra1Q9R118 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Htra1Q9R118 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Htra1Q9R118 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Htra1Q9R118 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Htra1Q9R118 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Htra1Q9R118 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Htra1Q9R118 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Htra1Q9R118 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Htra1Q9R118 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Htra1Q9R118 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Htra1Q9R118 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Htra1Q9R118 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Htra1Q9R118 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Htra1Q9R118 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Htra1Q9R118 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Htra1Q9R118 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Htra1Q9R118 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Htra1Q9R118 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Htra1Q9R118 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Htra1Q9R118 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Htra1Q9R118 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Htra1Q9R118 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Htra1Q9R118 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Htra1Q9R118 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Htra1Q9R118 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Htra1Q9R118 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Htra1Q9R118 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Htra1Q9R118 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Htra1Q9R118 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Htra1Q9R118 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Htra1Q9R118 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Htra1Q9R118 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Htra1Q9R118 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Htra1Q9R118 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Htra1Q9R118 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Htra1Q9R118 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Htra1Q9R118 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Htra1Q9R118 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Htra1Q9R118 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Htra1Q9R118 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Htra1Q9R118 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Htra1Q9R118 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Htra1Q9R118 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Htra1Q9R118 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Htra1Q9R118 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Htra1Q9R118 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Htra1Q9R118 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Htra1Q9R118 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Htra1Q9R118 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Htra1Q9R118 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Htra1Q9R118 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Htra1Q9R118 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Htra1Q9R118 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Htra1Q9R118 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Htra1Q9R118 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Htra1Q9R118 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Htra1Q9R118 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Htra1Q9R118 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Htra1Q9R118 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Htra1Q9R118 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Htra1Q9R118 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Htra1Q9R118 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Htra1Q9R118 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Htra1Q9R118 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Htra1Q9R118 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Htra1Q9R118 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Htra1Q9R118 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Htra1Q9R118 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Htra1Q9R118 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Htra1Q9R118 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Htra1Q9R118 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Htra1Q9R118 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Htra1Q9R118 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Htra1Q9R118 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Htra1Q9R118 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Htra1Q9R118 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Htra1Q9R118 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Htra1Q9R118 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Htra1Q9R118 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Htra1Q9R118 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Htra1Q9R118 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Htra1Q9R118 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Htra1Q9R118 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms