Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pard6bQ9JK83 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pard6bQ9JK83 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pard6bQ9JK83 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pard6bQ9JK83 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pard6bQ9JK83 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pard6bQ9JK83 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pard6bQ9JK83 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pard6bQ9JK83 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pard6bQ9JK83 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pard6bQ9JK83 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pard6bQ9JK83 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pard6bQ9JK83 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pard6bQ9JK83 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pard6bQ9JK83 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pard6bQ9JK83 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pard6bQ9JK83 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pard6bQ9JK83 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pard6bQ9JK83 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pard6bQ9JK83 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pard6bQ9JK83 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pard6bQ9JK83 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pard6bQ9JK83 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Pard6bQ9JK83 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pard6bQ9JK83 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Pard6bQ9JK83 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Pard6bQ9JK83 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pard6bQ9JK83 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pard6bQ9JK83 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pard6bQ9JK83 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pard6bQ9JK83 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pard6bQ9JK83 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pard6bQ9JK83 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pard6bQ9JK83 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pard6bQ9JK83 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pard6bQ9JK83 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pard6bQ9JK83 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pard6bQ9JK83 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pard6bQ9JK83 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pard6bQ9JK83 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pard6bQ9JK83 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pard6bQ9JK83 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pard6bQ9JK83 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pard6bQ9JK83 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pard6bQ9JK83 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pard6bQ9JK83 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pard6bQ9JK83 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pard6bQ9JK83 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pard6bQ9JK83 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pard6bQ9JK83 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pard6bQ9JK83 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pard6bQ9JK83 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pard6bQ9JK83 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pard6bQ9JK83 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pard6bQ9JK83 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pard6bQ9JK83 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pard6bQ9JK83 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pard6bQ9JK83 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pard6bQ9JK83 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pard6bQ9JK83 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pard6bQ9JK83 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pard6bQ9JK83 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pard6bQ9JK83 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pard6bQ9JK83 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pard6bQ9JK83 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pard6bQ9JK83 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pard6bQ9JK83 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pard6bQ9JK83 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pard6bQ9JK83 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pard6bQ9JK83 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pard6bQ9JK83 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pard6bQ9JK83 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pard6bQ9JK83 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pard6bQ9JK83 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pard6bQ9JK83 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pard6bQ9JK83 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pard6bQ9JK83 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pard6bQ9JK83 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pard6bQ9JK83 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pard6bQ9JK83 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pard6bQ9JK83 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pard6bQ9JK83 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pard6bQ9JK83 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Pard6bQ9JK83 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pard6bQ9JK83 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pard6bQ9JK83 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pard6bQ9JK83 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pard6bQ9JK83 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pard6bQ9JK83 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pard6bQ9JK83 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pard6bQ9JK83 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pard6bQ9JK83 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pard6bQ9JK83 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pard6bQ9JK83 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pard6bQ9JK83 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pard6bQ9JK83 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pard6bQ9JK83 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pard6bQ9JK83 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pard6bQ9JK83 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pard6bQ9JK83 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms