Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ72

Rprm, Protein reprimo, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RprmQ9JJ72 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RprmQ9JJ72 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RprmQ9JJ72 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
RprmQ9JJ72 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
RprmQ9JJ72 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RprmQ9JJ72 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RprmQ9JJ72 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RprmQ9JJ72 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RprmQ9JJ72 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RprmQ9JJ72 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RprmQ9JJ72 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RprmQ9JJ72 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RprmQ9JJ72 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RprmQ9JJ72 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RprmQ9JJ72 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RprmQ9JJ72 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RprmQ9JJ72 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RprmQ9JJ72 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RprmQ9JJ72 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RprmQ9JJ72 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RprmQ9JJ72 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RprmQ9JJ72 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RprmQ9JJ72 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RprmQ9JJ72 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RprmQ9JJ72 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RprmQ9JJ72 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RprmQ9JJ72 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RprmQ9JJ72 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RprmQ9JJ72 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RprmQ9JJ72 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RprmQ9JJ72 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RprmQ9JJ72 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RprmQ9JJ72 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RprmQ9JJ72 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RprmQ9JJ72 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RprmQ9JJ72 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RprmQ9JJ72 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RprmQ9JJ72 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RprmQ9JJ72 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RprmQ9JJ72 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RprmQ9JJ72 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RprmQ9JJ72 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RprmQ9JJ72 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RprmQ9JJ72 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RprmQ9JJ72 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RprmQ9JJ72 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RprmQ9JJ72 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RprmQ9JJ72 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RprmQ9JJ72 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RprmQ9JJ72 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RprmQ9JJ72 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RprmQ9JJ72 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RprmQ9JJ72 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RprmQ9JJ72 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RprmQ9JJ72 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RprmQ9JJ72 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RprmQ9JJ72 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RprmQ9JJ72 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RprmQ9JJ72 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RprmQ9JJ72 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RprmQ9JJ72 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RprmQ9JJ72 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RprmQ9JJ72 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RprmQ9JJ72 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RprmQ9JJ72 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RprmQ9JJ72 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RprmQ9JJ72 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RprmQ9JJ72 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RprmQ9JJ72 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RprmQ9JJ72 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RprmQ9JJ72 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RprmQ9JJ72 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RprmQ9JJ72 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RprmQ9JJ72 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RprmQ9JJ72 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RprmQ9JJ72 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RprmQ9JJ72 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RprmQ9JJ72 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RprmQ9JJ72 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RprmQ9JJ72 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RprmQ9JJ72 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RprmQ9JJ72 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RprmQ9JJ72 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RprmQ9JJ72 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RprmQ9JJ72 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RprmQ9JJ72 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RprmQ9JJ72 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RprmQ9JJ72 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RprmQ9JJ72 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RprmQ9JJ72 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RprmQ9JJ72 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RprmQ9JJ72 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RprmQ9JJ72 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RprmQ9JJ72 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RprmQ9JJ72 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RprmQ9JJ72 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RprmQ9JJ72 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RprmQ9JJ72 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RprmQ9JJ72 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RprmQ9JJ72 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms