Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES70

Nek6, Serine/threonine-protein kinase Nek6, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek6Q9ES70 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nek6Q9ES70 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek6Q9ES70 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nek6Q9ES70 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nek6Q9ES70 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek6Q9ES70 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek6Q9ES70 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek6Q9ES70 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek6Q9ES70 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek6Q9ES70 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek6Q9ES70 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek6Q9ES70 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek6Q9ES70 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek6Q9ES70 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek6Q9ES70 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek6Q9ES70 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek6Q9ES70 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek6Q9ES70 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek6Q9ES70 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek6Q9ES70 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek6Q9ES70 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nek6Q9ES70 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nek6Q9ES70 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nek6Q9ES70 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nek6Q9ES70 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nek6Q9ES70 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nek6Q9ES70 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nek6Q9ES70 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nek6Q9ES70 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nek6Q9ES70 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nek6Q9ES70 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nek6Q9ES70 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nek6Q9ES70 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nek6Q9ES70 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nek6Q9ES70 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nek6Q9ES70 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nek6Q9ES70 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nek6Q9ES70 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nek6Q9ES70 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nek6Q9ES70 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nek6Q9ES70 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Nek6Q9ES70 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nek6Q9ES70 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nek6Q9ES70 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nek6Q9ES70 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nek6Q9ES70 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nek6Q9ES70 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nek6Q9ES70 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nek6Q9ES70 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nek6Q9ES70 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nek6Q9ES70 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nek6Q9ES70 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nek6Q9ES70 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nek6Q9ES70 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nek6Q9ES70 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nek6Q9ES70 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nek6Q9ES70 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nek6Q9ES70 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Nek6Q9ES70 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nek6Q9ES70 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nek6Q9ES70 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nek6Q9ES70 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nek6Q9ES70 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nek6Q9ES70 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nek6Q9ES70 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nek6Q9ES70 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nek6Q9ES70 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nek6Q9ES70 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nek6Q9ES70 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nek6Q9ES70 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nek6Q9ES70 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Nek6Q9ES70 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nek6Q9ES70 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nek6Q9ES70 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nek6Q9ES70 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nek6Q9ES70 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nek6Q9ES70 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nek6Q9ES70 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nek6Q9ES70 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nek6Q9ES70 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nek6Q9ES70 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nek6Q9ES70 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nek6Q9ES70 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nek6Q9ES70 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nek6Q9ES70 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nek6Q9ES70 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Nek6Q9ES70 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nek6Q9ES70 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nek6Q9ES70 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nek6Q9ES70 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nek6Q9ES70 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nek6Q9ES70 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nek6Q9ES70 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nek6Q9ES70 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nek6Q9ES70 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nek6Q9ES70 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nek6Q9ES70 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nek6Q9ES70 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nek6Q9ES70 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nek6Q9ES70 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms