Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR1

Ndel1, Nuclear distribution protein nudE-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndel1Q9ERR1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ndel1Q9ERR1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ndel1Q9ERR1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ndel1Q9ERR1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ndel1Q9ERR1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ndel1Q9ERR1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ndel1Q9ERR1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ndel1Q9ERR1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ndel1Q9ERR1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ndel1Q9ERR1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ndel1Q9ERR1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ndel1Q9ERR1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ndel1Q9ERR1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ndel1Q9ERR1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ndel1Q9ERR1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ndel1Q9ERR1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ndel1Q9ERR1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ndel1Q9ERR1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ndel1Q9ERR1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ndel1Q9ERR1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ndel1Q9ERR1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ndel1Q9ERR1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ndel1Q9ERR1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndel1Q9ERR1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndel1Q9ERR1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ndel1Q9ERR1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ndel1Q9ERR1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ndel1Q9ERR1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ndel1Q9ERR1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndel1Q9ERR1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndel1Q9ERR1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndel1Q9ERR1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndel1Q9ERR1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ndel1Q9ERR1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ndel1Q9ERR1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ndel1Q9ERR1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ndel1Q9ERR1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ndel1Q9ERR1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndel1Q9ERR1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndel1Q9ERR1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ndel1Q9ERR1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndel1Q9ERR1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndel1Q9ERR1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndel1Q9ERR1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndel1Q9ERR1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ndel1Q9ERR1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ndel1Q9ERR1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ndel1Q9ERR1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ndel1Q9ERR1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndel1Q9ERR1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndel1Q9ERR1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndel1Q9ERR1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndel1Q9ERR1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndel1Q9ERR1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ndel1Q9ERR1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ndel1Q9ERR1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ndel1Q9ERR1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ndel1Q9ERR1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ndel1Q9ERR1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ndel1Q9ERR1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ndel1Q9ERR1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ndel1Q9ERR1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ndel1Q9ERR1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ndel1Q9ERR1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ndel1Q9ERR1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ndel1Q9ERR1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ndel1Q9ERR1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ndel1Q9ERR1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ndel1Q9ERR1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ndel1Q9ERR1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ndel1Q9ERR1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ndel1Q9ERR1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ndel1Q9ERR1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ndel1Q9ERR1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ndel1Q9ERR1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ndel1Q9ERR1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ndel1Q9ERR1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ndel1Q9ERR1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ndel1Q9ERR1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ndel1Q9ERR1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ndel1Q9ERR1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ndel1Q9ERR1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ndel1Q9ERR1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ndel1Q9ERR1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ndel1Q9ERR1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ndel1Q9ERR1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ndel1Q9ERR1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ndel1Q9ERR1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ndel1Q9ERR1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ndel1Q9ERR1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ndel1Q9ERR1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ndel1Q9ERR1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ndel1Q9ERR1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ndel1Q9ERR1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ndel1Q9ERR1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ndel1Q9ERR1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ndel1Q9ERR1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ndel1Q9ERR1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ndel1Q9ERR1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ndel1Q9ERR1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms