Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Dap3Q9ER88 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dap3Q9ER88 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dap3Q9ER88 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Dap3Q9ER88 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Dap3Q9ER88 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dap3Q9ER88 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dap3Q9ER88 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dap3Q9ER88 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dap3Q9ER88 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Dap3Q9ER88 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Dap3Q9ER88 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dap3Q9ER88 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dap3Q9ER88 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dap3Q9ER88 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Dap3Q9ER88 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Dap3Q9ER88 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dap3Q9ER88 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dap3Q9ER88 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Dap3Q9ER88 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dap3Q9ER88 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dap3Q9ER88 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Dap3Q9ER88 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dap3Q9ER88 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Dap3Q9ER88 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dap3Q9ER88 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dap3Q9ER88 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dap3Q9ER88 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Dap3Q9ER88 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Dap3Q9ER88 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dap3Q9ER88 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dap3Q9ER88 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Dap3Q9ER88 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dap3Q9ER88 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dap3Q9ER88 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dap3Q9ER88 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dap3Q9ER88 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dap3Q9ER88 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dap3Q9ER88 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Dap3Q9ER88 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Dap3Q9ER88 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Dap3Q9ER88 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dap3Q9ER88 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dap3Q9ER88 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dap3Q9ER88 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dap3Q9ER88 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dap3Q9ER88 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dap3Q9ER88 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dap3Q9ER88 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Dap3Q9ER88 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dap3Q9ER88 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dap3Q9ER88 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dap3Q9ER88 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dap3Q9ER88 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dap3Q9ER88 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Dap3Q9ER88 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dap3Q9ER88 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dap3Q9ER88 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dap3Q9ER88 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dap3Q9ER88 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dap3Q9ER88 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dap3Q9ER88 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dap3Q9ER88 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dap3Q9ER88 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dap3Q9ER88 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dap3Q9ER88 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dap3Q9ER88 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Dap3Q9ER88 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Dap3Q9ER88 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Dap3Q9ER88 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dap3Q9ER88 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dap3Q9ER88 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dap3Q9ER88 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dap3Q9ER88 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dap3Q9ER88 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dap3Q9ER88 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dap3Q9ER88 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dap3Q9ER88 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dap3Q9ER88 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dap3Q9ER88 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dap3Q9ER88 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dap3Q9ER88 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dap3Q9ER88 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dap3Q9ER88 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Dap3Q9ER88 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dap3Q9ER88 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dap3Q9ER88 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dap3Q9ER88 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dap3Q9ER88 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dap3Q9ER88 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Dap3Q9ER88 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dap3Q9ER88 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dap3Q9ER88 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dap3Q9ER88 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dap3Q9ER88 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dap3Q9ER88 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Dap3Q9ER88 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dap3Q9ER88 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dap3Q9ER88 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dap3Q9ER88 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.6 ms