Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPT1

Vmn1r63, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r63Q9EPT1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r63Q9EPT1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Vmn1r63Q9EPT1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Vmn1r63Q9EPT1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Vmn1r63Q9EPT1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Vmn1r63Q9EPT1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vmn1r63Q9EPT1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Vmn1r63Q9EPT1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r63Q9EPT1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r63Q9EPT1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r63Q9EPT1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r63Q9EPT1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vmn1r63Q9EPT1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r63Q9EPT1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r63Q9EPT1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Vmn1r63Q9EPT1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r63Q9EPT1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vmn1r63Q9EPT1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r63Q9EPT1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r63Q9EPT1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vmn1r63Q9EPT1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r63Q9EPT1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vmn1r63Q9EPT1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r63Q9EPT1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r63Q9EPT1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r63Q9EPT1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r63Q9EPT1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vmn1r63Q9EPT1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r63Q9EPT1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r63Q9EPT1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r63Q9EPT1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r63Q9EPT1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r63Q9EPT1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r63Q9EPT1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vmn1r63Q9EPT1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r63Q9EPT1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r63Q9EPT1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r63Q9EPT1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vmn1r63Q9EPT1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r63Q9EPT1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r63Q9EPT1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vmn1r63Q9EPT1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r63Q9EPT1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r63Q9EPT1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r63Q9EPT1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r63Q9EPT1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vmn1r63Q9EPT1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r63Q9EPT1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r63Q9EPT1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r63Q9EPT1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r63Q9EPT1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Vmn1r63Q9EPT1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r63Q9EPT1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r63Q9EPT1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vmn1r63Q9EPT1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vmn1r63Q9EPT1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r63Q9EPT1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vmn1r63Q9EPT1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r63Q9EPT1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r63Q9EPT1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r63Q9EPT1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r63Q9EPT1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r63Q9EPT1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r63Q9EPT1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vmn1r63Q9EPT1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r63Q9EPT1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r63Q9EPT1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r63Q9EPT1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r63Q9EPT1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vmn1r63Q9EPT1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r63Q9EPT1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r63Q9EPT1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vmn1r63Q9EPT1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r63Q9EPT1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r63Q9EPT1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r63Q9EPT1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r63Q9EPT1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vmn1r63Q9EPT1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r63Q9EPT1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r63Q9EPT1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r63Q9EPT1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vmn1r63Q9EPT1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r63Q9EPT1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vmn1r63Q9EPT1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r63Q9EPT1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r63Q9EPT1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vmn1r63Q9EPT1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vmn1r63Q9EPT1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r63Q9EPT1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r63Q9EPT1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r63Q9EPT1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r63Q9EPT1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r63Q9EPT1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r63Q9EPT1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r63Q9EPT1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vmn1r63Q9EPT1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r63Q9EPT1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r63Q9EPT1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vmn1r63Q9EPT1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r63Q9EPT1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms