Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL5

Mmp1a, Interstitial collagenase A, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp1aQ9EPL5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mmp1aQ9EPL5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mmp1aQ9EPL5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mmp1aQ9EPL5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Mmp1aQ9EPL5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mmp1aQ9EPL5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Mmp1aQ9EPL5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Mmp1aQ9EPL5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mmp1aQ9EPL5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mmp1aQ9EPL5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mmp1aQ9EPL5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mmp1aQ9EPL5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mmp1aQ9EPL5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mmp1aQ9EPL5 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Mmp1aQ9EPL5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mmp1aQ9EPL5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mmp1aQ9EPL5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mmp1aQ9EPL5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Mmp1aQ9EPL5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mmp1aQ9EPL5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mmp1aQ9EPL5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mmp1aQ9EPL5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mmp1aQ9EPL5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mmp1aQ9EPL5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mmp1aQ9EPL5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mmp1aQ9EPL5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mmp1aQ9EPL5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mmp1aQ9EPL5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mmp1aQ9EPL5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mmp1aQ9EPL5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mmp1aQ9EPL5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Mmp1aQ9EPL5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Mmp1aQ9EPL5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mmp1aQ9EPL5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mmp1aQ9EPL5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mmp1aQ9EPL5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mmp1aQ9EPL5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Mmp1aQ9EPL5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Mmp1aQ9EPL5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mmp1aQ9EPL5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Mmp1aQ9EPL5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mmp1aQ9EPL5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mmp1aQ9EPL5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mmp1aQ9EPL5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mmp1aQ9EPL5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mmp1aQ9EPL5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mmp1aQ9EPL5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mmp1aQ9EPL5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mmp1aQ9EPL5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Mmp1aQ9EPL5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mmp1aQ9EPL5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mmp1aQ9EPL5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mmp1aQ9EPL5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mmp1aQ9EPL5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mmp1aQ9EPL5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mmp1aQ9EPL5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mmp1aQ9EPL5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Mmp1aQ9EPL5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Mmp1aQ9EPL5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mmp1aQ9EPL5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mmp1aQ9EPL5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mmp1aQ9EPL5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mmp1aQ9EPL5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mmp1aQ9EPL5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mmp1aQ9EPL5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mmp1aQ9EPL5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mmp1aQ9EPL5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mmp1aQ9EPL5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Mmp1aQ9EPL5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mmp1aQ9EPL5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mmp1aQ9EPL5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mmp1aQ9EPL5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mmp1aQ9EPL5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mmp1aQ9EPL5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mmp1aQ9EPL5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mmp1aQ9EPL5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mmp1aQ9EPL5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mmp1aQ9EPL5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mmp1aQ9EPL5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Mmp1aQ9EPL5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mmp1aQ9EPL5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mmp1aQ9EPL5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mmp1aQ9EPL5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mmp1aQ9EPL5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mmp1aQ9EPL5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mmp1aQ9EPL5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mmp1aQ9EPL5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mmp1aQ9EPL5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mmp1aQ9EPL5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mmp1aQ9EPL5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mmp1aQ9EPL5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mmp1aQ9EPL5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mmp1aQ9EPL5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mmp1aQ9EPL5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mmp1aQ9EPL5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Mmp1aQ9EPL5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mmp1aQ9EPL5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mmp1aQ9EPL5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mmp1aQ9EPL5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Mmp1aQ9EPL5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms