Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCM4

Dnal4, Dynein light chain 4, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnal4Q9DCM4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnal4Q9DCM4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnal4Q9DCM4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnal4Q9DCM4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Dnal4Q9DCM4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnal4Q9DCM4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnal4Q9DCM4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnal4Q9DCM4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnal4Q9DCM4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Dnal4Q9DCM4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnal4Q9DCM4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnal4Q9DCM4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnal4Q9DCM4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Dnal4Q9DCM4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnal4Q9DCM4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnal4Q9DCM4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Dnal4Q9DCM4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnal4Q9DCM4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnal4Q9DCM4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Dnal4Q9DCM4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnal4Q9DCM4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnal4Q9DCM4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Dnal4Q9DCM4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnal4Q9DCM4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnal4Q9DCM4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Dnal4Q9DCM4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnal4Q9DCM4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnal4Q9DCM4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnal4Q9DCM4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnal4Q9DCM4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Dnal4Q9DCM4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnal4Q9DCM4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnal4Q9DCM4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Dnal4Q9DCM4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnal4Q9DCM4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnal4Q9DCM4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Dnal4Q9DCM4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnal4Q9DCM4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnal4Q9DCM4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Dnal4Q9DCM4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnal4Q9DCM4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Dnal4Q9DCM4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Dnal4Q9DCM4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Dnal4Q9DCM4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Dnal4Q9DCM4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnal4Q9DCM4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnal4Q9DCM4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnal4Q9DCM4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnal4Q9DCM4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnal4Q9DCM4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnal4Q9DCM4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnal4Q9DCM4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dnal4Q9DCM4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnal4Q9DCM4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnal4Q9DCM4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnal4Q9DCM4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnal4Q9DCM4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnal4Q9DCM4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnal4Q9DCM4 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dnal4Q9DCM4 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnal4Q9DCM4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnal4Q9DCM4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnal4Q9DCM4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnal4Q9DCM4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dnal4Q9DCM4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnal4Q9DCM4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnal4Q9DCM4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnal4Q9DCM4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnal4Q9DCM4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnal4Q9DCM4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dnal4Q9DCM4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnal4Q9DCM4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnal4Q9DCM4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dnal4Q9DCM4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnal4Q9DCM4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnal4Q9DCM4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnal4Q9DCM4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnal4Q9DCM4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dnal4Q9DCM4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnal4Q9DCM4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnal4Q9DCM4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnal4Q9DCM4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnal4Q9DCM4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnal4Q9DCM4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnal4Q9DCM4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnal4Q9DCM4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnal4Q9DCM4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnal4Q9DCM4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Dnal4Q9DCM4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnal4Q9DCM4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnal4Q9DCM4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnal4Q9DCM4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnal4Q9DCM4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Dnal4Q9DCM4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnal4Q9DCM4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnal4Q9DCM4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnal4Q9DCM4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnal4Q9DCM4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Dnal4Q9DCM4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Dnal4Q9DCM4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms