Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ftsj3Q9DBE9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ftsj3Q9DBE9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ftsj3Q9DBE9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ftsj3Q9DBE9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ftsj3Q9DBE9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ftsj3Q9DBE9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ftsj3Q9DBE9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ftsj3Q9DBE9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ftsj3Q9DBE9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ftsj3Q9DBE9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ftsj3Q9DBE9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ftsj3Q9DBE9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ftsj3Q9DBE9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ftsj3Q9DBE9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ftsj3Q9DBE9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ftsj3Q9DBE9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ftsj3Q9DBE9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ftsj3Q9DBE9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ftsj3Q9DBE9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ftsj3Q9DBE9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ftsj3Q9DBE9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ftsj3Q9DBE9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ftsj3Q9DBE9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ftsj3Q9DBE9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ftsj3Q9DBE9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ftsj3Q9DBE9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ftsj3Q9DBE9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ftsj3Q9DBE9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ftsj3Q9DBE9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ftsj3Q9DBE9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ftsj3Q9DBE9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ftsj3Q9DBE9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ftsj3Q9DBE9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ftsj3Q9DBE9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ftsj3Q9DBE9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ftsj3Q9DBE9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ftsj3Q9DBE9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ftsj3Q9DBE9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ftsj3Q9DBE9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Ftsj3Q9DBE9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ftsj3Q9DBE9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ftsj3Q9DBE9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ftsj3Q9DBE9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ftsj3Q9DBE9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ftsj3Q9DBE9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ftsj3Q9DBE9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ftsj3Q9DBE9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Ftsj3Q9DBE9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ftsj3Q9DBE9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ftsj3Q9DBE9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ftsj3Q9DBE9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ftsj3Q9DBE9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ftsj3Q9DBE9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ftsj3Q9DBE9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ftsj3Q9DBE9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ftsj3Q9DBE9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ftsj3Q9DBE9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Ftsj3Q9DBE9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ftsj3Q9DBE9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ftsj3Q9DBE9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ftsj3Q9DBE9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ftsj3Q9DBE9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ftsj3Q9DBE9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ftsj3Q9DBE9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ftsj3Q9DBE9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ftsj3Q9DBE9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ftsj3Q9DBE9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ftsj3Q9DBE9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ftsj3Q9DBE9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ftsj3Q9DBE9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ftsj3Q9DBE9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ftsj3Q9DBE9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ftsj3Q9DBE9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ftsj3Q9DBE9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ftsj3Q9DBE9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ftsj3Q9DBE9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ftsj3Q9DBE9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ftsj3Q9DBE9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ftsj3Q9DBE9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ftsj3Q9DBE9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ftsj3Q9DBE9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ftsj3Q9DBE9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Ftsj3Q9DBE9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ftsj3Q9DBE9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ftsj3Q9DBE9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ftsj3Q9DBE9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ftsj3Q9DBE9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ftsj3Q9DBE9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ftsj3Q9DBE9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ftsj3Q9DBE9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ftsj3Q9DBE9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ftsj3Q9DBE9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ftsj3Q9DBE9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ftsj3Q9DBE9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ftsj3Q9DBE9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ftsj3Q9DBE9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ftsj3Q9DBE9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ftsj3Q9DBE9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ftsj3Q9DBE9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms