Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc94Q9D6J3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc94Q9D6J3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc94Q9D6J3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc94Q9D6J3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc94Q9D6J3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc94Q9D6J3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc94Q9D6J3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ccdc94Q9D6J3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc94Q9D6J3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc94Q9D6J3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc94Q9D6J3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc94Q9D6J3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc94Q9D6J3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc94Q9D6J3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc94Q9D6J3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc94Q9D6J3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc94Q9D6J3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc94Q9D6J3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc94Q9D6J3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc94Q9D6J3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc94Q9D6J3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc94Q9D6J3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc94Q9D6J3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc94Q9D6J3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc94Q9D6J3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc94Q9D6J3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc94Q9D6J3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc94Q9D6J3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc94Q9D6J3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc94Q9D6J3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc94Q9D6J3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc94Q9D6J3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc94Q9D6J3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc94Q9D6J3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc94Q9D6J3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc94Q9D6J3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc94Q9D6J3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc94Q9D6J3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc94Q9D6J3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc94Q9D6J3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc94Q9D6J3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc94Q9D6J3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc94Q9D6J3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc94Q9D6J3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc94Q9D6J3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc94Q9D6J3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc94Q9D6J3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc94Q9D6J3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc94Q9D6J3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc94Q9D6J3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc94Q9D6J3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc94Q9D6J3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc94Q9D6J3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc94Q9D6J3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc94Q9D6J3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc94Q9D6J3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc94Q9D6J3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc94Q9D6J3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc94Q9D6J3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc94Q9D6J3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc94Q9D6J3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc94Q9D6J3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc94Q9D6J3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc94Q9D6J3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc94Q9D6J3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc94Q9D6J3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc94Q9D6J3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc94Q9D6J3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc94Q9D6J3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc94Q9D6J3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc94Q9D6J3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc94Q9D6J3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc94Q9D6J3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc94Q9D6J3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc94Q9D6J3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ccdc94Q9D6J3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc94Q9D6J3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc94Q9D6J3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc94Q9D6J3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc94Q9D6J3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc94Q9D6J3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc94Q9D6J3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc94Q9D6J3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc94Q9D6J3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc94Q9D6J3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc94Q9D6J3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc94Q9D6J3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc94Q9D6J3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc94Q9D6J3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc94Q9D6J3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc94Q9D6J3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc94Q9D6J3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc94Q9D6J3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc94Q9D6J3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc94Q9D6J3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc94Q9D6J3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc94Q9D6J3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc94Q9D6J3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc94Q9D6J3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms