Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q9D454 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Q9D454 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Q9D454 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Q9D454 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Q9D454 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Q9D454 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Q9D454 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Q9D454 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Q9D454 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q9D454 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q9D454 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q9D454 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q9D454 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Q9D454 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Q9D454 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Q9D454 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q9D454 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Q9D454 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q9D454 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q9D454 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q9D454 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Q9D454 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Q9D454 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Q9D454 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Q9D454 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Q9D454 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q9D454 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q9D454 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q9D454 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q9D454 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q9D454 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q9D454 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q9D454 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q9D454 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Q9D454 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q9D454 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Q9D454 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Q9D454 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Q9D454 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Q9D454 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Q9D454 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Q9D454 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Q9D454 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Q9D454 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Q9D454 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Q9D454 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Q9D454 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q9D454 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Q9D454 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q9D454 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q9D454 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Q9D454 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Q9D454 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Q9D454 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Q9D454 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Q9D454 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Q9D454 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Q9D454 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Q9D454 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Q9D454 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Q9D454 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Q9D454 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Q9D454 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Q9D454 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Q9D454 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Q9D454 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q9D454 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q9D454 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Q9D454 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q9D454 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Q9D454 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Q9D454 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Q9D454 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Q9D454 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Q9D454 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Q9D454 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q9D454 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Q9D454 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Q9D454 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Q9D454 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Q9D454 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Q9D454 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q9D454 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q9D454 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Q9D454 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q9D454 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q9D454 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q9D454 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q9D454 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Q9D454 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q9D454 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Q9D454 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q9D454 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Q9D454 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q9D454 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Q9D454 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q9D454 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Q9D454 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Q9D454 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms