Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SarnpQ9D1J3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SarnpQ9D1J3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SarnpQ9D1J3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SarnpQ9D1J3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SarnpQ9D1J3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SarnpQ9D1J3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SarnpQ9D1J3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SarnpQ9D1J3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SarnpQ9D1J3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SarnpQ9D1J3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SarnpQ9D1J3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SarnpQ9D1J3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SarnpQ9D1J3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SarnpQ9D1J3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SarnpQ9D1J3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SarnpQ9D1J3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SarnpQ9D1J3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SarnpQ9D1J3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SarnpQ9D1J3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SarnpQ9D1J3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SarnpQ9D1J3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SarnpQ9D1J3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SarnpQ9D1J3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SarnpQ9D1J3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SarnpQ9D1J3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SarnpQ9D1J3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SarnpQ9D1J3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SarnpQ9D1J3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SarnpQ9D1J3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SarnpQ9D1J3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SarnpQ9D1J3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SarnpQ9D1J3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SarnpQ9D1J3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SarnpQ9D1J3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SarnpQ9D1J3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SarnpQ9D1J3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SarnpQ9D1J3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SarnpQ9D1J3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SarnpQ9D1J3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SarnpQ9D1J3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SarnpQ9D1J3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SarnpQ9D1J3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SarnpQ9D1J3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SarnpQ9D1J3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SarnpQ9D1J3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SarnpQ9D1J3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SarnpQ9D1J3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SarnpQ9D1J3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SarnpQ9D1J3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SarnpQ9D1J3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SarnpQ9D1J3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SarnpQ9D1J3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SarnpQ9D1J3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SarnpQ9D1J3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SarnpQ9D1J3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SarnpQ9D1J3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SarnpQ9D1J3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SarnpQ9D1J3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SarnpQ9D1J3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SarnpQ9D1J3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SarnpQ9D1J3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SarnpQ9D1J3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SarnpQ9D1J3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SarnpQ9D1J3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SarnpQ9D1J3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SarnpQ9D1J3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SarnpQ9D1J3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SarnpQ9D1J3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SarnpQ9D1J3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SarnpQ9D1J3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SarnpQ9D1J3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SarnpQ9D1J3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SarnpQ9D1J3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SarnpQ9D1J3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SarnpQ9D1J3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SarnpQ9D1J3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SarnpQ9D1J3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SarnpQ9D1J3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SarnpQ9D1J3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SarnpQ9D1J3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SarnpQ9D1J3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SarnpQ9D1J3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SarnpQ9D1J3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SarnpQ9D1J3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SarnpQ9D1J3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SarnpQ9D1J3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SarnpQ9D1J3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SarnpQ9D1J3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SarnpQ9D1J3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SarnpQ9D1J3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SarnpQ9D1J3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SarnpQ9D1J3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SarnpQ9D1J3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SarnpQ9D1J3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SarnpQ9D1J3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SarnpQ9D1J3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SarnpQ9D1J3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SarnpQ9D1J3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SarnpQ9D1J3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms