Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl11Q9CXW4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl11Q9CXW4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl11Q9CXW4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpl11Q9CXW4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpl11Q9CXW4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl11Q9CXW4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl11Q9CXW4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl11Q9CXW4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpl11Q9CXW4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl11Q9CXW4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl11Q9CXW4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpl11Q9CXW4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl11Q9CXW4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl11Q9CXW4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl11Q9CXW4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl11Q9CXW4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl11Q9CXW4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpl11Q9CXW4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl11Q9CXW4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpl11Q9CXW4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl11Q9CXW4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl11Q9CXW4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl11Q9CXW4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl11Q9CXW4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl11Q9CXW4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpl11Q9CXW4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl11Q9CXW4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpl11Q9CXW4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl11Q9CXW4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl11Q9CXW4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl11Q9CXW4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl11Q9CXW4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl11Q9CXW4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpl11Q9CXW4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl11Q9CXW4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl11Q9CXW4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl11Q9CXW4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpl11Q9CXW4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rpl11Q9CXW4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl11Q9CXW4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl11Q9CXW4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpl11Q9CXW4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl11Q9CXW4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl11Q9CXW4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl11Q9CXW4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl11Q9CXW4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl11Q9CXW4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl11Q9CXW4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl11Q9CXW4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl11Q9CXW4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl11Q9CXW4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl11Q9CXW4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl11Q9CXW4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl11Q9CXW4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl11Q9CXW4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl11Q9CXW4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpl11Q9CXW4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl11Q9CXW4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl11Q9CXW4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl11Q9CXW4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl11Q9CXW4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl11Q9CXW4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl11Q9CXW4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl11Q9CXW4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl11Q9CXW4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl11Q9CXW4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rpl11Q9CXW4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rpl11Q9CXW4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl11Q9CXW4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl11Q9CXW4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl11Q9CXW4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl11Q9CXW4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl11Q9CXW4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl11Q9CXW4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl11Q9CXW4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl11Q9CXW4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl11Q9CXW4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl11Q9CXW4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl11Q9CXW4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl11Q9CXW4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl11Q9CXW4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl11Q9CXW4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl11Q9CXW4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl11Q9CXW4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl11Q9CXW4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl11Q9CXW4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl11Q9CXW4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl11Q9CXW4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl11Q9CXW4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl11Q9CXW4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl11Q9CXW4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl11Q9CXW4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl11Q9CXW4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl11Q9CXW4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl11Q9CXW4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl11Q9CXW4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl11Q9CXW4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl11Q9CXW4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl11Q9CXW4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms