Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RpainQ9CWY9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RpainQ9CWY9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RpainQ9CWY9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RpainQ9CWY9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RpainQ9CWY9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RpainQ9CWY9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RpainQ9CWY9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RpainQ9CWY9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RpainQ9CWY9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RpainQ9CWY9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RpainQ9CWY9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RpainQ9CWY9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RpainQ9CWY9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RpainQ9CWY9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RpainQ9CWY9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RpainQ9CWY9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RpainQ9CWY9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RpainQ9CWY9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RpainQ9CWY9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RpainQ9CWY9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RpainQ9CWY9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RpainQ9CWY9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
RpainQ9CWY9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RpainQ9CWY9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RpainQ9CWY9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RpainQ9CWY9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RpainQ9CWY9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RpainQ9CWY9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RpainQ9CWY9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RpainQ9CWY9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RpainQ9CWY9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RpainQ9CWY9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RpainQ9CWY9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RpainQ9CWY9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RpainQ9CWY9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RpainQ9CWY9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RpainQ9CWY9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RpainQ9CWY9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RpainQ9CWY9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RpainQ9CWY9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RpainQ9CWY9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RpainQ9CWY9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RpainQ9CWY9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RpainQ9CWY9 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RpainQ9CWY9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RpainQ9CWY9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RpainQ9CWY9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RpainQ9CWY9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RpainQ9CWY9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RpainQ9CWY9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RpainQ9CWY9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RpainQ9CWY9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RpainQ9CWY9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RpainQ9CWY9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RpainQ9CWY9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RpainQ9CWY9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RpainQ9CWY9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RpainQ9CWY9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RpainQ9CWY9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RpainQ9CWY9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RpainQ9CWY9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RpainQ9CWY9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RpainQ9CWY9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RpainQ9CWY9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RpainQ9CWY9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RpainQ9CWY9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RpainQ9CWY9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RpainQ9CWY9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RpainQ9CWY9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RpainQ9CWY9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RpainQ9CWY9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RpainQ9CWY9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RpainQ9CWY9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RpainQ9CWY9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RpainQ9CWY9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RpainQ9CWY9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RpainQ9CWY9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RpainQ9CWY9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RpainQ9CWY9 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RpainQ9CWY9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RpainQ9CWY9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RpainQ9CWY9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RpainQ9CWY9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RpainQ9CWY9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RpainQ9CWY9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RpainQ9CWY9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RpainQ9CWY9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RpainQ9CWY9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RpainQ9CWY9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RpainQ9CWY9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RpainQ9CWY9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RpainQ9CWY9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RpainQ9CWY9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RpainQ9CWY9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RpainQ9CWY9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RpainQ9CWY9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RpainQ9CWY9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RpainQ9CWY9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RpainQ9CWY9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
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