Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUS9

Sppl3, Signal peptide peptidase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl3Q9CUS9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sppl3Q9CUS9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sppl3Q9CUS9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sppl3Q9CUS9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sppl3Q9CUS9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Sppl3Q9CUS9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sppl3Q9CUS9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
Sppl3Q9CUS9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sppl3Q9CUS9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sppl3Q9CUS9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sppl3Q9CUS9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Sppl3Q9CUS9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sppl3Q9CUS9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sppl3Q9CUS9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sppl3Q9CUS9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sppl3Q9CUS9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sppl3Q9CUS9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sppl3Q9CUS9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sppl3Q9CUS9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Sppl3Q9CUS9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Sppl3Q9CUS9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sppl3Q9CUS9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sppl3Q9CUS9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sppl3Q9CUS9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sppl3Q9CUS9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sppl3Q9CUS9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sppl3Q9CUS9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sppl3Q9CUS9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sppl3Q9CUS9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sppl3Q9CUS9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sppl3Q9CUS9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sppl3Q9CUS9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sppl3Q9CUS9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sppl3Q9CUS9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sppl3Q9CUS9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sppl3Q9CUS9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sppl3Q9CUS9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sppl3Q9CUS9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sppl3Q9CUS9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Sppl3Q9CUS9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sppl3Q9CUS9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sppl3Q9CUS9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sppl3Q9CUS9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sppl3Q9CUS9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sppl3Q9CUS9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sppl3Q9CUS9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sppl3Q9CUS9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sppl3Q9CUS9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sppl3Q9CUS9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sppl3Q9CUS9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sppl3Q9CUS9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sppl3Q9CUS9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sppl3Q9CUS9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sppl3Q9CUS9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Sppl3Q9CUS9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sppl3Q9CUS9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Sppl3Q9CUS9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sppl3Q9CUS9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sppl3Q9CUS9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sppl3Q9CUS9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sppl3Q9CUS9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sppl3Q9CUS9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sppl3Q9CUS9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sppl3Q9CUS9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sppl3Q9CUS9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sppl3Q9CUS9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sppl3Q9CUS9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sppl3Q9CUS9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sppl3Q9CUS9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sppl3Q9CUS9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sppl3Q9CUS9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sppl3Q9CUS9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sppl3Q9CUS9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sppl3Q9CUS9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sppl3Q9CUS9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sppl3Q9CUS9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sppl3Q9CUS9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sppl3Q9CUS9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Sppl3Q9CUS9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sppl3Q9CUS9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Sppl3Q9CUS9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sppl3Q9CUS9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sppl3Q9CUS9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sppl3Q9CUS9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sppl3Q9CUS9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sppl3Q9CUS9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sppl3Q9CUS9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sppl3Q9CUS9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sppl3Q9CUS9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sppl3Q9CUS9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sppl3Q9CUS9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sppl3Q9CUS9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Sppl3Q9CUS9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sppl3Q9CUS9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sppl3Q9CUS9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sppl3Q9CUS9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sppl3Q9CUS9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sppl3Q9CUS9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sppl3Q9CUS9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sppl3Q9CUS9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms