Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rprd1bQ9CSU0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rprd1bQ9CSU0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rprd1bQ9CSU0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rprd1bQ9CSU0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rprd1bQ9CSU0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rprd1bQ9CSU0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rprd1bQ9CSU0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rprd1bQ9CSU0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rprd1bQ9CSU0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rprd1bQ9CSU0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rprd1bQ9CSU0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rprd1bQ9CSU0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rprd1bQ9CSU0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rprd1bQ9CSU0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rprd1bQ9CSU0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rprd1bQ9CSU0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rprd1bQ9CSU0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rprd1bQ9CSU0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rprd1bQ9CSU0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rprd1bQ9CSU0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rprd1bQ9CSU0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rprd1bQ9CSU0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rprd1bQ9CSU0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rprd1bQ9CSU0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rprd1bQ9CSU0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rprd1bQ9CSU0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rprd1bQ9CSU0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rprd1bQ9CSU0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rprd1bQ9CSU0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rprd1bQ9CSU0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rprd1bQ9CSU0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rprd1bQ9CSU0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rprd1bQ9CSU0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rprd1bQ9CSU0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rprd1bQ9CSU0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rprd1bQ9CSU0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rprd1bQ9CSU0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rprd1bQ9CSU0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rprd1bQ9CSU0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rprd1bQ9CSU0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rprd1bQ9CSU0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rprd1bQ9CSU0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rprd1bQ9CSU0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rprd1bQ9CSU0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rprd1bQ9CSU0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rprd1bQ9CSU0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rprd1bQ9CSU0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rprd1bQ9CSU0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rprd1bQ9CSU0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rprd1bQ9CSU0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rprd1bQ9CSU0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rprd1bQ9CSU0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rprd1bQ9CSU0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rprd1bQ9CSU0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rprd1bQ9CSU0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rprd1bQ9CSU0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rprd1bQ9CSU0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rprd1bQ9CSU0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rprd1bQ9CSU0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rprd1bQ9CSU0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rprd1bQ9CSU0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rprd1bQ9CSU0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rprd1bQ9CSU0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rprd1bQ9CSU0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rprd1bQ9CSU0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rprd1bQ9CSU0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rprd1bQ9CSU0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rprd1bQ9CSU0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rprd1bQ9CSU0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rprd1bQ9CSU0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rprd1bQ9CSU0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rprd1bQ9CSU0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rprd1bQ9CSU0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rprd1bQ9CSU0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rprd1bQ9CSU0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rprd1bQ9CSU0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rprd1bQ9CSU0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rprd1bQ9CSU0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rprd1bQ9CSU0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rprd1bQ9CSU0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rprd1bQ9CSU0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rprd1bQ9CSU0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rprd1bQ9CSU0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rprd1bQ9CSU0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rprd1bQ9CSU0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rprd1bQ9CSU0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rprd1bQ9CSU0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rprd1bQ9CSU0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rprd1bQ9CSU0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rprd1bQ9CSU0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rprd1bQ9CSU0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rprd1bQ9CSU0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rprd1bQ9CSU0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rprd1bQ9CSU0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rprd1bQ9CSU0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rprd1bQ9CSU0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rprd1bQ9CSU0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rprd1bQ9CSU0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms