Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR23

Tmem9, Transmembrane protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem9Q9CR23 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem9Q9CR23 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem9Q9CR23 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem9Q9CR23 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem9Q9CR23 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem9Q9CR23 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem9Q9CR23 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem9Q9CR23 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem9Q9CR23 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem9Q9CR23 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem9Q9CR23 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem9Q9CR23 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem9Q9CR23 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem9Q9CR23 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem9Q9CR23 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem9Q9CR23 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem9Q9CR23 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem9Q9CR23 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem9Q9CR23 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem9Q9CR23 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem9Q9CR23 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem9Q9CR23 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem9Q9CR23 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem9Q9CR23 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem9Q9CR23 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem9Q9CR23 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tmem9Q9CR23 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem9Q9CR23 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tmem9Q9CR23 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tmem9Q9CR23 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem9Q9CR23 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem9Q9CR23 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem9Q9CR23 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem9Q9CR23 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tmem9Q9CR23 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem9Q9CR23 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem9Q9CR23 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tmem9Q9CR23 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem9Q9CR23 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem9Q9CR23 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem9Q9CR23 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tmem9Q9CR23 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem9Q9CR23 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem9Q9CR23 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem9Q9CR23 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem9Q9CR23 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem9Q9CR23 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem9Q9CR23 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem9Q9CR23 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem9Q9CR23 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem9Q9CR23 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem9Q9CR23 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem9Q9CR23 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem9Q9CR23 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem9Q9CR23 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem9Q9CR23 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem9Q9CR23 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem9Q9CR23 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem9Q9CR23 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem9Q9CR23 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem9Q9CR23 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmem9Q9CR23 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem9Q9CR23 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem9Q9CR23 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem9Q9CR23 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem9Q9CR23 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem9Q9CR23 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem9Q9CR23 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem9Q9CR23 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem9Q9CR23 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem9Q9CR23 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem9Q9CR23 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem9Q9CR23 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem9Q9CR23 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem9Q9CR23 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem9Q9CR23 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem9Q9CR23 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem9Q9CR23 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem9Q9CR23 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem9Q9CR23 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem9Q9CR23 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem9Q9CR23 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem9Q9CR23 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem9Q9CR23 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem9Q9CR23 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem9Q9CR23 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem9Q9CR23 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem9Q9CR23 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem9Q9CR23 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem9Q9CR23 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem9Q9CR23 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem9Q9CR23 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem9Q9CR23 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem9Q9CR23 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem9Q9CR23 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem9Q9CR23 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem9Q9CR23 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem9Q9CR23 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem9Q9CR23 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem9Q9CR23 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms