Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY8

Tm4sf20, Transmembrane 4 L6 family member 20, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf20Q9CQY8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tm4sf20Q9CQY8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tm4sf20Q9CQY8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tm4sf20Q9CQY8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tm4sf20Q9CQY8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tm4sf20Q9CQY8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tm4sf20Q9CQY8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tm4sf20Q9CQY8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tm4sf20Q9CQY8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tm4sf20Q9CQY8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tm4sf20Q9CQY8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tm4sf20Q9CQY8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tm4sf20Q9CQY8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tm4sf20Q9CQY8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tm4sf20Q9CQY8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tm4sf20Q9CQY8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tm4sf20Q9CQY8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tm4sf20Q9CQY8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tm4sf20Q9CQY8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tm4sf20Q9CQY8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tm4sf20Q9CQY8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tm4sf20Q9CQY8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tm4sf20Q9CQY8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tm4sf20Q9CQY8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tm4sf20Q9CQY8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tm4sf20Q9CQY8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tm4sf20Q9CQY8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tm4sf20Q9CQY8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tm4sf20Q9CQY8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tm4sf20Q9CQY8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tm4sf20Q9CQY8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tm4sf20Q9CQY8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tm4sf20Q9CQY8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tm4sf20Q9CQY8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tm4sf20Q9CQY8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tm4sf20Q9CQY8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tm4sf20Q9CQY8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tm4sf20Q9CQY8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tm4sf20Q9CQY8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tm4sf20Q9CQY8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tm4sf20Q9CQY8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tm4sf20Q9CQY8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tm4sf20Q9CQY8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tm4sf20Q9CQY8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tm4sf20Q9CQY8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tm4sf20Q9CQY8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tm4sf20Q9CQY8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tm4sf20Q9CQY8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tm4sf20Q9CQY8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tm4sf20Q9CQY8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tm4sf20Q9CQY8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tm4sf20Q9CQY8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tm4sf20Q9CQY8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tm4sf20Q9CQY8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tm4sf20Q9CQY8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tm4sf20Q9CQY8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tm4sf20Q9CQY8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tm4sf20Q9CQY8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tm4sf20Q9CQY8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tm4sf20Q9CQY8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tm4sf20Q9CQY8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tm4sf20Q9CQY8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tm4sf20Q9CQY8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tm4sf20Q9CQY8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tm4sf20Q9CQY8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tm4sf20Q9CQY8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tm4sf20Q9CQY8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tm4sf20Q9CQY8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tm4sf20Q9CQY8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tm4sf20Q9CQY8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tm4sf20Q9CQY8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tm4sf20Q9CQY8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tm4sf20Q9CQY8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tm4sf20Q9CQY8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms